Atomistic Simulation Tutorial

1. Introduction

• Atomistic Simulation Tutorial
• Atomistic simulation introduction

• ASE Basic

• ASE Structure

• ASE Calculator

• Atomsの操作

• Atomsの操作2

• Diatomic Potential

2. Opt (構造最適化)

• Opt

• [Advanced] 対称性を考慮した構造最適化
• Optimization algorithm

3. Energy

• Bulk energy

• Slab energy

• Slab + mol energy

• Nano particle energy

• [Advanced] Nano particle energy

4. Vibration, phonon, 各種自由エネルギー

• 振動解析 - Vibration Analysis
• Phonon

5. 反応経路探索

• 反応経路解析 - Reaction Path Analysis
• 不均一系触媒上の反応解析（NEB法）

6. MD (分子動力学法)

• 分子動力学シミュレーション
• カノニカル（NVT）アンサンブル
• 等圧等温（NPT）アンサンブル

7. おわりに

• おわりに

Appendix

• Appendix 1: Visualization
• Appendix 2: Opt algorithm fmax experiment