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Atomistic Simulation Tutorial
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Atomistic Simulation Tutorial
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1. Introduction
Atomistic Simulation Tutorial
Atomistic simulation introduction
ASE Basic
ASE Structure
ASE Calculator
Atomsの操作
Atomsの操作2
Diatomic Potential
2. Opt (構造最適化)
Opt
[Advanced] 対称性を考慮した構造最適化
Optimization algorithm
3. Energy
Bulk energy
Slab energy
Slab + mol energy
Nano particle energy
[Advanced] Nano particle energy
4. Vibration, phonon, 各種自由エネルギー
振動解析 - Vibration Analysis
Phonon
5. 反応経路探索
反応経路解析 - Reaction Path Analysis
不均一系触媒上の反応解析（NEB法）
6. MD (分子動力学法)
分子動力学シミュレーション
カノニカル（NVT）アンサンブル
等圧等温（NPT）アンサンブル
7. おわりに
おわりに
Appendix
Appendix 1: Visualization
Appendix 2: Opt algorithm fmax experiment
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